萬昌大米水稻秧田制作分三步進行：首先把耕耙一般選用冬閑田作秧田，前作收后隨即翻耕，翻耕不宜太深，一般以15cm為宜，其次作床濕潤育秧要求通透性良好的“通氣秧田”，苗床特點是上糊下松，通氣保溫，易排易灌；其三秧田培肥底肥以有機肥為主，化肥為輔，有機肥要細，要充分腐熟。
秧苗不同生育階段要求的適宜溫度不同，播種到出苗階段棚內溫度控制在30℃左右。該階段由于棚外溫度較低，應以密封保溫為主，苗床上應覆蓋一層地膜，增強保溫效果。
水稻的整個過程是喜溫狀態，水稻1.5葉期棚內溫度不能超過22-25℃：在晴好的天氣提早通風，棚布不要落到底，肩部通風煉苗。水稻2.5葉期棚內溫度不能超過20-22℃，此時若溫度超過25℃極易造成早穗現象，根據天氣情況多設通風口大通風煉苗；2.5葉期后根據天氣情況(夜間溫度高于8℃)逐漸轉入晝夜通風煉苗。
